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La Science de la logique (1812-1816), située entre la Phénoménologie de l'esprit et l'Encyclopédie des sciences philosophiques, est au centre du système hégélien. En effet, une fois réduit le dualisme propre à la conscience commune, Hegel en vient ici aux structures intemporelles du connaître et de la réalité, avant que celle-ci ne trouve son exposition dans l'élément du concept. Dans son organisation ? Logique objective, avec les livres de l'Etre et de la Doctrine de l'essence, et Logique subjective ou doctrine du concept ?, la Science de la logique répond à l'ambition de son auteur, qui est de produire une logique qui soit une véritable ontologie.